Eu tive esse erro e consegui resolver assim:

Primeiramente vamos no arquivo config.default.php dentro da pasta xampp conforme caminho abaixo


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c:\xampp\phpMyAdmin\libraries\config.default.php

Procure por : 

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$cfg['ExecTimeLimit'] = 600;

E basta mudar para 6000 e boommm

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$cfg['ExecTimeLimit'] = 6000;

Reinicie o Apache 

Abraços